十年前Cloud Computing火爆的時(shí)候，大家自然而然開(kāi)始了想站在生物云計(jì)算的風(fēng)口，可是沒(méi)起風(fēng)，豬肉去漲價(jià)了。生物云計(jì)算究竟是遺失的美好，還是霧里看花，水中望月;究竟是出身未捷身先死，還是懷才不遇，壯志未酬。

生物云計(jì)算，看上去很美

首先，我們的定義是什么?

按照字面定義，目的就是做生物的計(jì)算，主要包括各種生物序列的分析工作，加上云，就是能夠在云端處理。其實(shí)和其他云計(jì)算也沒(méi)太大的不同。這是非常好的想法，后面在結(jié)合上5G技術(shù)，就更好了。比如在野外利用孔測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序，數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)傳輸?shù)皆贫碎_(kāi)始處理，然后結(jié)果返回結(jié)果。通過(guò)各種終端都可以直接查看結(jié)果，看起來(lái)非常好是不是。

然而現(xiàn)實(shí)情況是，這些年很多公司推出的生物云計(jì)算，大方向都是在炒概念，生物大數(shù)據(jù)，生物云計(jì)算，5G，物聯(lián)網(wǎng)，人工智能，精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)……都是當(dāng)前時(shí)髦的熱詞，如果不帶幾個(gè)這樣的詞兒，都不好意思和別人打招呼。但是當(dāng)街頭老大媽都準(zhǔn)備入市賺錢(qián)的時(shí)候，也就說(shuō)明股市泡沫要來(lái)了。

硅谷有一個(gè)臭名昭著的技術(shù)成熟度曲線，也叫做技術(shù)循環(huán)曲線，或者直接叫做炒作周期，是指新技術(shù)、新概念在媒體上曝光度隨時(shí)間的變化曲線。是指經(jīng)過(guò)新聞媒體和學(xué)術(shù)會(huì)議的大肆宣傳之后，新技術(shù)趨勢(shì)一下子跌倒了谷底。生物云計(jì)算就是這樣的一個(gè)例子。

生物云計(jì)算的烏托邦之夢(mèng)

云計(jì)算其實(shí)是一種非常好的解決方案。然而目前為何還沒(méi)有完全普及，雖然市面上有很多產(chǎn)品，有些做得確實(shí)也還可以，但依然不是主流。能效升近7萬(wàn)倍!新興超導(dǎo)量子技術(shù)實(shí)現(xiàn)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)硬件加速系統(tǒng)

很多公司的產(chǎn)品是想做成傻瓜式的操作，有一個(gè)圖形化界面，用戶購(gòu)買(mǎi)之后，登錄賬戶，然后上傳數(shù)據(jù)，選擇要分析的流程，點(diǎn)擊運(yùn)行，然后等待結(jié)果就行，用戶體驗(yàn)非常好是不是，你甚至不需要任何生物信息經(jīng)驗(yàn)就可以了。

利用這段時(shí)間，去樓下點(diǎn)上一杯咖啡，曬曬太陽(yáng)，伸個(gè)懶腰，刷刷手機(jī)，然后回來(lái)等待結(jié)果就行了，生活真美好……

甚至還有很多人預(yù)言，已經(jīng)不需要做生物信息的人了，這些工作會(huì)像精算師一樣逐漸被生物云計(jì)算以及人工智能所取代，這個(gè)我不肯定也不否定。

夢(mèng)醒時(shí)分喝完咖啡回來(lái)，查看一下結(jié)果。“wow，fxxx”，出錯(cuò)了，到底哪里有問(wèn)題呢?這就是當(dāng)前生物云計(jì)算的問(wèn)題所在。將所有分析封裝起來(lái)，如果中間環(huán)節(jié)有問(wèn)題，就比較麻煩。

舉個(gè)簡(jiǎn)單的例子，

例如做人全基因組的變異檢測(cè)。從拿到原始測(cè)序數(shù)據(jù)，到最終得到可靠的結(jié)果，中間可能需要10幾個(gè)處理過(guò)程。這些過(guò)程都是承上啟下的，有一個(gè)過(guò)程有問(wèn)題，整個(gè)流程就斷掉。如果斷掉在查找原因，重新從這里開(kāi)始，這反而更加繁瑣。

其次，

像這種非常標(biāo)準(zhǔn)化的分析過(guò)程，采用目前的云計(jì)算是沒(méi)有問(wèn)題的。但如果是做科學(xué)研究?？茖W(xué)研究本身就是一個(gè)反復(fù)探索的過(guò)程，需要反復(fù)測(cè)試，不斷調(diào)參，使用這種圖形化反而更加復(fù)雜。

第三：

所有圖形化本質(zhì)上只不過(guò)是給命令行添加上一個(gè)按鈕，本質(zhì)上內(nèi)容都是一樣的，根本不存在不懂生物信息也能使用的情況，如果不懂的話那些參數(shù)就只能按照默認(rèn)的來(lái)處理了。

回到未來(lái)

由于當(dāng)前的生物云計(jì)算現(xiàn)實(shí)情況，就會(huì)造成一種現(xiàn)象：懂分析的人不喜歡圖形界面，不懂分析的人有了圖形界面也還是不會(huì)用。我并不是一棒子打死各種生物云計(jì)算，每個(gè)用戶的具體需求不同，具體分析內(nèi)容也不同，有些分析云計(jì)算非常方便。相反，我覺(jué)得需要生物云計(jì)算，甚至我們自己也運(yùn)營(yíng)生物云計(jì)算平臺(tái)，只不過(guò)不是圖形化界面，需要用戶自己熟悉敲命令。

其實(shí)云計(jì)算有諸多的優(yōu)勢(shì)。

首先，

方便數(shù)據(jù)管理，也就是同一份文件不需要進(jìn)行多個(gè)拷貝，測(cè)序完成之后直接上傳到云服務(wù)器，用戶可以在任何地點(diǎn)聯(lián)網(wǎng)訪問(wèn)。

第二，

軟件和數(shù)據(jù)庫(kù)也無(wú)需進(jìn)行多個(gè)拷貝，并且可以第一時(shí)間進(jìn)行更新，省去很多麻煩，例如，只需要在云端下載一份nt數(shù)據(jù)庫(kù)，所有的用戶都可以與之進(jìn)行比對(duì)，而不需要下載很多份。

第三，

云計(jì)算可以進(jìn)行彈性計(jì)算，也就是資源可以充分利用，需要多大資源，就提供多大資源，不會(huì)像本地資源存在計(jì)算資源不足的情況。

第四，

云計(jì)算不需要很多的配置以及系統(tǒng)維護(hù)。

當(dāng)前文章：吹了十幾年的生物云計(jì)算，為什么還在原地踏步呢？
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