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大數(shù)據(jù)架構在醫(yī)療行業(yè)中的應用

2021-02-12    分類: 網站建設

醫(yī)療數(shù)據(jù)較為復雜,以醫(yī)院來說建設的業(yè)務系統(tǒng)接近百來個,例如HIS系統(tǒng)、急診系統(tǒng)、護理系統(tǒng)、電子病歷系統(tǒng)、檢驗系統(tǒng)、檢查系統(tǒng)、輸血系統(tǒng)、生殖中心系統(tǒng)、體檢系統(tǒng)等,每個業(yè)務廠家不同,設計不同,盡管醫(yī)院都依照不同的主題建立部分分析型數(shù)據(jù)應用,但還是較為孤立的系統(tǒng),醫(yī)院也建立了集成平臺,從業(yè)務的角度規(guī)范業(yè)務傳輸,同時在集成平臺基礎上了建立了臨床數(shù)據(jù)中心,但都不是從醫(yī)院整體數(shù)據(jù)中心管理為出發(fā)點,都是從數(shù)據(jù)應用為出發(fā)點。

現(xiàn)大數(shù)據(jù)技術已逐漸趨于成熟,衛(wèi)生信息化建設也不斷加快,醫(yī)療數(shù)據(jù)類型、標準和規(guī)模也日益增長,醫(yī)療已全面進入“大數(shù)據(jù)時代”,怎樣結合大數(shù)據(jù)技術對醫(yī)院數(shù)據(jù)進行治理、管理及應用成為關鍵話題,數(shù)據(jù)中心管理不局限于某個分析主題、科研主題,而不是手工或是后臺數(shù)據(jù)庫呈現(xiàn)方式,而是利用系統(tǒng)將數(shù)據(jù)標準、數(shù)據(jù)中心建立、數(shù)據(jù)采集、數(shù)據(jù)校驗、數(shù)據(jù)分類、管理及應用智能管理起來。

數(shù)據(jù)中心管理系統(tǒng)建設

建立數(shù)據(jù)中心管理,規(guī)范數(shù)據(jù)中心設計,管理采集來源,將醫(yī)院各業(yè)務系統(tǒng)數(shù)據(jù)有序有量的加載到數(shù)據(jù)中心庫中,為數(shù)據(jù)類應用服務提供相應基礎,該平臺利用大數(shù)據(jù)技術[3]Hadoop中的分布式文件存儲(HDFS)系統(tǒng)保存數(shù)據(jù)以及分布式實時處理框架(Spark)計算平臺來實現(xiàn)。

系統(tǒng)架構 數(shù)據(jù)中心管理系統(tǒng)架構見圖1。

圖1 數(shù)據(jù)中心管理系統(tǒng)架構

基礎層:基礎層是指與醫(yī)院數(shù)據(jù)決策支持平臺有數(shù)據(jù)交互的系統(tǒng)中的數(shù)據(jù),主要是HIS、EMR、PACS、LIS等醫(yī)院業(yè)務系統(tǒng)。從業(yè)務系統(tǒng)抽取、轉換等過程后加載到數(shù)據(jù)中心;交換層:將kettle封裝到該中心管理系統(tǒng)中,將數(shù)據(jù)采集到數(shù)據(jù)中心,將整個采集過程及數(shù)據(jù)校驗可視化;數(shù)據(jù)中心管理層:建立標準化管理,數(shù)據(jù)中心自由構建,將采集方式、數(shù)據(jù)模型等進行統(tǒng)一管理,建立智能化數(shù)據(jù)管理平臺,利用分布式存儲技術將數(shù)據(jù)分為不同的數(shù)據(jù)中心存儲hbase數(shù)據(jù)庫中;數(shù)據(jù)門戶:統(tǒng)一數(shù)據(jù)輸出管理,針對前端應用的需求,根據(jù)不同的需求類型、需求操作范圍、需求的數(shù)據(jù)范圍、需求操作流程進行管理,對數(shù)據(jù)實現(xiàn)智能檢索功能;交互層:可將數(shù)據(jù)放到不同的媒介進行展現(xiàn),同時可對接醫(yī)院公有云或區(qū)域公有云等。

數(shù)據(jù)中心管理組件 建立數(shù)據(jù)中心管理組件,包括基礎資源庫、元數(shù)據(jù)管理組件、值域代碼管理組件、數(shù)據(jù)集管理組件、數(shù)據(jù)抽取及監(jiān)控組件、數(shù)據(jù)檢驗組件、模型管理組件、指標管理組件等,為數(shù)據(jù)中心的各種重要功能提供可視化統(tǒng)一管理工具。

基礎資源庫 包括整個平臺從各個業(yè)務系統(tǒng)(HIS、EMR、LIS、PACS)中抽取并集成的各類標準數(shù)據(jù)信息,例如運營數(shù)據(jù)中心、臨床數(shù)據(jù)中心、科研數(shù)據(jù)中心,采用NoSQL數(shù)據(jù)庫存儲方式。

元數(shù)據(jù)管理 元數(shù)據(jù)是數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)管理功能的基本,是提供數(shù)據(jù)追溯的最基本單位。元數(shù)據(jù)管理模塊需要按照標準去制定,有版本管理,所有的數(shù)據(jù)中心的建立都依賴于標準的元數(shù)據(jù)。用于定義字段名、字段內部ID,字段類型等,可內置國家標準、省標準或是建立醫(yī)院內部標準,用戶整個數(shù)據(jù)中心設計的統(tǒng)一管理,同時為互聯(lián)互通提供數(shù)據(jù)標準。

數(shù)據(jù)集管理 數(shù)據(jù)集管理主要是管理由元數(shù)據(jù)組成的不同數(shù)據(jù)集,例如病人基礎信息、病人醫(yī)囑、病人收費等,主要應用于國家、省等標準集管理,管理相應的版本、與元數(shù)據(jù)的關系等。

數(shù)據(jù)中心管理 可通過數(shù)據(jù)集或數(shù)據(jù)元自動建立數(shù)據(jù)中心表,同時對表中元數(shù)據(jù)的標準、數(shù)據(jù)類型、來源、來源表、來源字段和目標、目標表、目標字段等進行管理,方便用戶追溯數(shù)據(jù)的來源及自定義表單。醫(yī)院可通過數(shù)據(jù)中心管理查詢到醫(yī)院數(shù)據(jù)標準化程度,同時為數(shù)據(jù)模型提供來源。

標準字典管理 值域是標準字典允許值的集合,一個允許值是某個值和該值的含義的組合,值的含義稱為值含義。例如,“患者病情狀態(tài)”數(shù)據(jù)字典的值域是:①危急,②嚴重,③一般。其中①、②和③是值,其值含義分別是危急、嚴重和一般。

標準字典表的基本信息管理包括:類別、元數(shù)據(jù)類型、值域名稱、值域標識符、定義等,用戶可建立醫(yī)院內部標準字典,或是內置國家頒布,在管理過程中建立標準對照功能主要是將醫(yī)院業(yè)務系統(tǒng)與數(shù)據(jù)中心定義標準進行值的對照,亦可通過該平臺發(fā)布同步機制,影響業(yè)務系統(tǒng)按照規(guī)定的字典標準統(tǒng)一更新。

數(shù)據(jù)采集管理 將kettle的采集過程進行可視化管理,主要目的是為了能了解后臺數(shù)據(jù)抽取邏輯業(yè)務狀態(tài),如:業(yè)務邏輯的執(zhí)行是否成功、業(yè)務邏輯的執(zhí)行日志信息詳情等,本功能可以通過作業(yè)名稱、關聯(lián)的分析主題、執(zhí)行時間、完成時間、執(zhí)行狀態(tài)來過濾數(shù)據(jù);可以停止/開啟執(zhí)行數(shù)據(jù)抽取作業(yè);可以手動直接作業(yè),篩選作業(yè)抽取的時間;還可以直接進行數(shù)據(jù)校驗功能。

數(shù)據(jù)校驗管理 數(shù)據(jù)校驗主要是對抽取過來的數(shù)據(jù)進行一致性及準確性的校驗。

創(chuàng)建數(shù)據(jù)校驗時維護字段包括:數(shù)據(jù)校驗名稱、校驗數(shù)據(jù)庫ID、校驗語句、源數(shù)據(jù)庫ID、源數(shù)據(jù)校驗語句。

具體功能實現(xiàn):可以點擊校驗,篩選校驗開始時間、結束時間;可以停止/開啟執(zhí)行數(shù)據(jù)抽取作業(yè);可以手動直接作業(yè),篩選作業(yè)抽取的時間,點擊數(shù)據(jù)校驗,還可以跳轉到數(shù)據(jù)校驗。

可自動校驗、手動校驗;自動校驗是設定固定時間校驗、校驗時間段(可配置)、如若校驗不一致可自動回退校驗期間的數(shù)值進行數(shù)據(jù)重抽功能。

數(shù)據(jù)模型管理 利用Saliku在數(shù)據(jù)中心基礎上建立多個數(shù)據(jù)應用模型,同時將其模型管理起來,管理模型的關聯(lián)關系,模型內部指標集,定義指標來源、出處、規(guī)則、含義等,為規(guī)劃指標統(tǒng)計規(guī)則,為規(guī)范指標的統(tǒng)計規(guī)則及含義,對指標統(tǒng)計進行流程化管理,可在該平臺上申請指標定義及統(tǒng)計規(guī)則,由專人負責審核,完成整個數(shù)據(jù)流的管理工作,用戶在通過數(shù)據(jù)模型自由構建報表時可查詢該指標列規(guī)則、出處、內容,同時可點擊校驗該指標數(shù)據(jù)是否抽取完整。

數(shù)據(jù)檢索功能 建立可視化數(shù)據(jù)檢索功能,在數(shù)據(jù)模型的基礎上,根據(jù)用戶權限分配不同的數(shù)據(jù)權限,用戶可以自由配置篩選條件及所需展現(xiàn)內容。

數(shù)據(jù)統(tǒng)一管理門戶 為提供統(tǒng)一的數(shù)據(jù)管理門戶,用戶可在自身的權限范圍內,享受平臺提供的各項應用功能。

權限設置與用戶認證:平臺對用戶應用訪問進行控制,只有包含在受控的用戶列表中的用戶才能瀏覽系統(tǒng)應用,系統(tǒng)根據(jù)不同的用戶權限展示允許范圍內的報表信息;用戶類型分組:為了控制平臺應用服務的訪問權限,將系統(tǒng)用戶劃分為不同的類型,如:管理員、科研人員、管理者等。不同的用戶類型享用不同的應用服務,也就是對查詢信息擁有不同的訪問權限;數(shù)據(jù)對外管理:當其他系統(tǒng)調用數(shù)據(jù)中心時,[請確認修改]管理其數(shù)據(jù)去向、數(shù)據(jù)權限、數(shù)據(jù)安全;數(shù)據(jù)日志管理:對數(shù)據(jù)訪問痕跡,數(shù)據(jù)日志,數(shù)據(jù)修改,數(shù)據(jù)報表建立等進行相應管理;數(shù)據(jù)應用類系統(tǒng):將數(shù)據(jù)相關應用類產品實現(xiàn)統(tǒng)一的單點登錄,如科研管理、院長平臺、藥學管理、醫(yī)保控費、單病種管理等;首頁個性化設定:用戶可根據(jù)修改系統(tǒng)膚色及、可自由配置首頁、組合所關注的特定報表、特定功能菜單。

當前題目:大數(shù)據(jù)架構在醫(yī)療行業(yè)中的應用
文章路徑:http://jinyejixie.com/news/100565.html

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