Linux下如何運(yùn)行sql腳本

Linux運(yùn)行sql腳本的具體操作步驟如下：

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1、使用shell工具登陸到安裝postgresql的服務(wù)器，切換到postgres用戶，postgresql默認(rèn)的操作用戶，命令是：su - postgres，查看當(dāng)前路徑是/var/lib/psql，創(chuàng)建一個(gè)test.sql腳本文件，命令是：vim test.sql。

2、sql腳本內(nèi)容是：create table test (id int not null primary key,name text);insert into test valus(1, 't1');

3、執(zhí)行test.sql腳本，命令是：psql -f test.sql

這里是因?yàn)閜ostgresql安裝本機(jī)上，在第一步中我們切換到了postgres用戶，因此這里默認(rèn)就是postgres用戶來操作，不用帶上用戶名和密碼。執(zhí)行結(jié)果如下，可以看到有兩個(gè)提示：

create table

insert 0 1

執(zhí)行完成后，我們登入數(shù)據(jù)庫(kù)，命令是：psql

4、進(jìn)入psql交互式命令行后，我們執(zhí)行兩個(gè)查看命令：\d

可以看到表test確實(shí)已經(jīng)創(chuàng)建成功，然后執(zhí)行命令：\d test

可以看到表中字段是id和name，和我們創(chuàng)建語句中內(nèi)容一樣，說明第一條語句執(zhí)行成功。

5、查看表中數(shù)據(jù)，命令是：select * from test;

顯示出來的值是1，t1，說明第二條執(zhí)行語句也執(zhí)行成功，說明test.sql腳本執(zhí)行成功。

6、默認(rèn)是postgres用戶，本機(jī)操作是，不需要用戶和密碼，現(xiàn)在我們來試試操作遠(yuǎn)程linux服務(wù)器上的postgresql，也就是說執(zhí)行本地的腳本文件，在遠(yuǎn)程服務(wù)器上創(chuàng)建表。如下面圖中所示，命令是：psql -U test1 -h 192.168.1.194 -f test.sql，輸入對(duì)應(yīng)用戶的密碼。

7、登陸到這個(gè)遠(yuǎn)程服務(wù)器上，命令是：psql -U test -h 192.168.194

執(zhí)行查看命令：\d，\d test

最后查詢數(shù)據(jù)庫(kù)：select * from test;結(jié)果和上面都一致。

Linux 命令 & shell 腳本之01(cp & scp命令)

Linux cp命令主要用于復(fù)制文件或目錄

1.語法

2.參數(shù)說明

3.案例

3.1. cp 命令基本用法

3.2 復(fù)制目錄

3.3 復(fù)制軟鏈接文件

3.4. 保留源文件屬性復(fù)制

3.5. "-l" 和 "-s" 選項(xiàng)

4.cat

6.linux快速刪除大量文件

學(xué)生信的那些事兒之七 - Linux基礎(chǔ)之Shell腳本編程

沿著前面的軌跡，接下來是Linux中shell腳本的學(xué)習(xí)。這對(duì)于生信工程師后續(xù)處理大量 (海量更合適些) 數(shù)據(jù)是非常非常重要的，但是同樣的，作為一個(gè)有點(diǎn)古板的人，對(duì)于"腳本"是什么意思我都死磕了好久。主要覺得有些抽象，尤其是跟生信的同事討論項(xiàng)目分析部分的問題時(shí)，他們經(jīng)常會(huì)說道這個(gè)詞，在他們意識(shí)里這是個(gè)不言自明的術(shù)語，殊不知對(duì)外行人而言 (比如我)，那簡(jiǎn)直就是無情的"知識(shí)的詛咒"。經(jīng)常是我假裝聽懂了，然后繼續(xù)討論下面的問題，形成一個(gè)模糊的印象。

百度上的解釋是：腳本（Script）是一種批處理文件的延伸，是一種純文本保存的程序，一般來說的計(jì)算機(jī)腳本程序是確定的一系列控制計(jì)算機(jī)進(jìn)行運(yùn)算操作動(dòng)作的組合，在其中可以實(shí)現(xiàn)一定的邏輯分支等。不知道你能不能看懂，反正我開始的時(shí)候真是一知半解。

鳥哥私房菜的解釋是：shell script是利用 shell 的功能所寫的一個(gè)"程序"，這個(gè)程序是使用純文本文件，將一些shell的語法與命令(含外部命令)寫在里面，搭配正則表達(dá)式、管道命令與數(shù)據(jù)流重定向等功能，以達(dá)到我們所想要的處理的目的。不明覺厲，好像更看不懂了···

Jude 的簡(jiǎn)單粗暴大白話解釋是：腳本就是Linux中很多命令按照一定規(guī)則的組合，以實(shí)現(xiàn)某個(gè)特定的功能。Linux中有很多簡(jiǎn)單的命令，往往只是進(jìn)行了簡(jiǎn)單的對(duì)話，比如 cd 就是進(jìn)入到某個(gè)目錄，簡(jiǎn)單直接。但是如果我想進(jìn)入某個(gè)目錄A，然后在目錄A中創(chuàng)建目錄B，再在目錄B中創(chuàng)建文本C呢？當(dāng)然可以一步一步操作，如果想要一步到位呢，那就可以用腳本，把三個(gè)命令寫在一起，一起執(zhí)行。好像有點(diǎn)啰嗦···

或者從英語的角度去理解，腳本的對(duì)應(yīng)英文是Script，而這個(gè)單詞的中文釋義中還有劇本的意思。劇本就好理解了啊，劇本就是導(dǎo)演(生信工程師)基于某個(gè)主旨(要實(shí)現(xiàn)的目標(biāo))按照一定的手法(規(guī)則)所寫的一個(gè)故事。不管是哪個(gè)演員，都得按照劇本演。所以，學(xué)好英語對(duì)于生信也是有幫助的~

按照腳本的復(fù)雜程度可以分為：

這個(gè)無需多說，其實(shí)就是若干個(gè)簡(jiǎn)單命令的順序排列，執(zhí)行腳本后會(huì)按照命令的前后關(guān)系從前往后一一執(zhí)行。

相對(duì)于簡(jiǎn)單的基本腳本，結(jié)構(gòu)化的命令腳本可以施加邏輯流程控制，從而改變程序(命令)執(zhí)行的順序。基本腳本中的命令就是從上往下執(zhí)行，但是結(jié)構(gòu)化的命令腳本可以根據(jù)邏輯判斷重復(fù)或者跳過某些命令。

常用的結(jié)構(gòu)化命令(語句)有：

后面還有什么嵌套循環(huán)啊啥的，不過我覺得上面的7中命令學(xué)到家了，應(yīng)該可以應(yīng)付大部分在生信分析里面的應(yīng)用了。

記得高中的時(shí)候，物理老師(也是班主任)在給我們講解習(xí)題時(shí)有個(gè)有意思的套路：不管什么難題現(xiàn)在下面寫個(gè)"答："，以示自己解決問題的決心，也是一種正向的心理暗示。腳本編寫也是有套路的，不過總的來說還是比較簡(jiǎn)單。

對(duì)于簡(jiǎn)單的腳本(超級(jí)簡(jiǎn)單的那種)，直接幾個(gè)命令連在一起即可，中間用"；"隔開。

對(duì)于更長(zhǎng)更復(fù)雜的腳本，一般需要?jiǎng)?chuàng)建一個(gè)文本，并在里面編輯。這就涉及到了文本編輯器，比較常用和簡(jiǎn)單的一般有nano和vim，實(shí)在很簡(jiǎn)單，規(guī)則也容易理解，教程隨手可得，不多說。

比如用vim創(chuàng)建了一個(gè)腳本之后，具體的語法(套路)：

ok，腳本寫完了，怎么讓腳本開始工作呢？這有涉及到之前講過的環(huán)境變量和相對(duì)路徑、絕對(duì)路徑了。方法有三：

就這么多吧，應(yīng)該有點(diǎn)感覺到了，剩下的就是狂練狂練了~

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