1、解壓壓縮包到go工作目錄,如解壓到E:\opensource\go\go,解壓后的目錄結(jié)構(gòu)如下:E:\opensource\go\go├─api├─bin│├─go.exe│├─godoc.exe│└─gofmt.exe├─doc├─include├─lib├─misc├─pkg├─src└─test2、增加環(huán)境變量GOROOT,取值為上面的go工作目錄3、Path環(huán)境變量中添加";%GOROOT%\bin",以便能夠直接調(diào)用go命令來編譯go代碼,至此go編譯環(huán)境就配置好了注:如果不想手動設(shè)置系統(tǒng)環(huán)境變量,也可下載go啟動環(huán)境批處理附件,修改goenv.bat文件中的GOROOT值為上面的go工作目錄后直接雙擊該bat文件,go編譯環(huán)境變量即設(shè)置完成。4、測試go編譯環(huán)境,啟動一個cmd窗口,直接輸入go,看到下面的提示就是搭建成功了E:\opensource\go\gogoGoisatoolformanagingGosourcecode.Usage:gocommand[arguments]Thecommandsare:buildcompilepackagesanddependenciescleanremoveobjectfilesdocrungodoconpackagesourcesenvprintGoenvironmentinformationfixrungotoolfixonpackagesfmtrungofmtonpackagesourcesgetdownloadandinstallpackagesanddependenciesinstallcompileandinstallpackagesanddependencieslistlistpackagesruncompileandrunGoprogramtesttestpackagestoolrunspecifiedgotoolversionprintGoversionvetrungotoolvetonpackagesUse"gohelp[command]"formoreinformationaboutacommand.Additionalhelptopics:gopathGOPATHenvironmentvariablepackagesdescriptionofpackagelistsremoteremoteimportpathsyntaxtestflagdescriptionoftestingflagstestfuncdescriptionoftestingfunctionsUse"gohelp[topic]"formoreinformationaboutthattopic.5、編譯helloworld測試程序,go語言包中test目錄帶有helloworld.go測試程序,源碼見"附一helloworld.go",直接調(diào)用"gobuildhelloworld.go"就生成了"helloworld.exe"可執(zhí)行程序,運行一下這個程序看到了我們期望的hello,wolrd。E:\opensource\go\go\testgobuildhelloworld.goE:\opensource\go\go\testhelloworld.exehello,worldE:\opensource\go\go\test附一helloworld.go//cmpout//Copyright2009TheGoAuthors.Allrightsreserved.//UseofthissourcecodeisgovernedbyaBSD-style//licensethatcanbefoundintheLICENSEfile.//Testthatwecandopage1oftheCbook.packagemainfuncmain(){print("hello,world\n")}
武侯網(wǎng)站制作公司哪家好,找創(chuàng)新互聯(lián)公司!從網(wǎng)頁設(shè)計、網(wǎng)站建設(shè)、微信開發(fā)、APP開發(fā)、成都響應(yīng)式網(wǎng)站建設(shè)公司等網(wǎng)站項目制作,到程序開發(fā),運營維護。創(chuàng)新互聯(lián)公司于2013年成立到現(xiàn)在10年的時間,我們擁有了豐富的建站經(jīng)驗和運維經(jīng)驗,來保證我們的工作的順利進行。專注于網(wǎng)站建設(shè)就選創(chuàng)新互聯(lián)公司。
ID轉(zhuǎn)換用到的是 bitr() 函數(shù),bitr()的使用方法:
org.Hs.eg.db包含有多種gene_name的類型
keytypes() :keytypes(x),查看注釋包中可以使用的類型
columns() :類似于keytypes(),針對org.Hs.eg.db兩個函數(shù)返回值一致
select() :select(x, keys, columns, keytype, ...) eg.
函數(shù)enrichGO()進行GO富集分析,enrichGO()的使用方法:
舉例:
揉了揉眼睛再次確認,沒錯了,確實報錯了,那屏幕上每個紅色的字符都仿佛在嘲笑的我的粗淺的知識和自負的勇氣。
我用顫抖的手指敲了幾下鍵盤,在Google上搜索著這個錯誤,在反復瀏覽了48萬毫秒后,自信的笑容逐漸在臉上浮現(xiàn)了出來,對的,沒有錯,我找到答案了。你也好奇答案是什么對嗎? 且聽我慢慢道來:
我們只需要使用 chown 命令將 /usr/local/go/pkg/darwin_amd64/ 的權(quán)限變更為登錄用戶即可,具體執(zhí)行命令如下:
那么問題來了,如何查看當前的 [用戶名] 呢?執(zhí)行 whoami 命令即可:
那么我們最終執(zhí)行的命令就是:
好了,再次按下 Command + R 執(zhí)行項目,發(fā)現(xiàn)順暢的如同久逢甘霖的大地和瞬間通暢的便秘,怎一個爽字了得。
不過,好像有個什么問題被我們漏掉了,為什么在之前的老Mac電腦上搭建Go的開發(fā)環(huán)境沒有遇到過這個問題呢? 仔細查了一下,這是一個Golang/go的一個Bug,是因為VSCode Go擴展程序使用 -i 選項導致的。有興趣的同學可以自行查閱Issue: golang/go#37962
如果這個方案解決了您的問題,請幫忙點贊??,讓其他同學更直觀的看到這個解決方案是有效的。
前面我給大家詳細介紹過
?GO簡介及GO富集結(jié)果解讀
?四種GO富集柱形圖、氣泡圖解讀
?GO富集分析四種風格展示結(jié)果—柱形圖,氣泡圖
?KEGG富集分析—柱形圖,氣泡圖,通路圖
? DAVID GO和KEGG富集分析及結(jié)果可視化
也用視頻給大家介紹過
? GO和KEGG富集分析視頻講解
最近有粉絲反映說,利用clusterProfiler這個包繪制GO富集分析氣泡圖和柱形圖的時候,發(fā)現(xiàn)GO條目的名字都重疊在一起了。
氣泡圖
柱形圖
這個圖別說美觀了,簡直不忍直視。經(jīng)過我的認真研究,發(fā)現(xiàn)跟R版本有關(guān)。前面我給大家展示的基本都是R 3.6.3做出來的圖。很多粉絲可能用的都是最新版本的R 4.1.2。
我們知道R的版本在不停的更新,相應(yīng)的R包也在不停的更新。我把繪制氣泡圖和柱形圖相關(guān)的函數(shù)拿出來認真的研究了一下,終于發(fā)現(xiàn)的癥結(jié)所在。
dotplot這個函數(shù),多了個 label_format 參數(shù)
我們來看看這個參數(shù)究竟是干什么用的,看看參數(shù)說明
label_format :
a numeric value sets wrap length, alternatively a custom function to format axis labels. by default wraps names longer that 30 characters
原來這個參數(shù)默認值是30,當標簽的長度大于30個字符就會被折疊,用多行來展示。既然問題找到了,我們就來調(diào)節(jié)一下這個參數(shù),把他設(shè)置成100,讓我們的標簽可以一行展示。
是不是還是原來的配方,還是熟悉的味道
同樣的柱形圖,我們也能讓他恢復原來的容貌。
關(guān)于如何使用R做GO和KEGG富集分析,可參考下文
GO和KEGG富集分析視頻講解
當前標題:go語言調(diào)用r語言命令 go語言orm
轉(zhuǎn)載來于:http://jinyejixie.com/article4/ddissoe.html
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