本篇內(nèi)容介紹了“使用Sklearn進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘的步驟”的有關(guān)知識,在實際案例的操作過程中,不少人都會遇到這樣的困境,接下來就讓小編帶領(lǐng)大家學(xué)習(xí)一下如何處理這些情況吧!希望大家仔細(xì)閱讀,能夠?qū)W有所成!
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1 使用sklearn進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘
1.1 數(shù)據(jù)挖掘的步驟
數(shù)據(jù)挖掘通常包括數(shù)據(jù)采集,數(shù)據(jù)分析,特征工程,訓(xùn)練模型,模型評估等步驟。使用sklearn工具可以方便地進(jìn)行特征工程和模型訓(xùn)練工作,在《使用sklearn做單機(jī)特征工程》中,我們***留下了一些疑問:特征處理類都有三個方法fit、transform和fit_transform,fit方法居然和模型訓(xùn)練方法fit同名(不光同名,參數(shù)列表都一樣),這難道都是巧合?
顯然,這不是巧合,這正是sklearn的設(shè)計風(fēng)格。我們能夠更加優(yōu)雅地使用sklearn進(jìn)行特征工程和模型訓(xùn)練工作。此時,不妨從一個基本的數(shù)據(jù)挖掘場景入手:
我們使用sklearn進(jìn)行虛線框內(nèi)的工作(sklearn也可以進(jìn)行文本特征提取)。通過分析sklearn源碼,我們可以看到除訓(xùn)練,預(yù)測和評估以外,處理其他工作的類都實現(xiàn)了3個方法:fit、transform和fit_transform。從命名中可以看到,fit_transform方法是先調(diào)用fit然后調(diào)用transform,我們只需要關(guān)注fit方法和transform方法即可。
transform方法主要用來對特征進(jìn)行轉(zhuǎn)換。從可利用信息的角度來說,轉(zhuǎn)換分為無信息轉(zhuǎn)換和有信息轉(zhuǎn)換。無信息轉(zhuǎn)換是指不利用任何其他信息進(jìn)行轉(zhuǎn)換,比如指數(shù)、對數(shù)函數(shù)轉(zhuǎn)換等。有信息轉(zhuǎn)換從是否利用目標(biāo)值向量又可分為無監(jiān)督轉(zhuǎn)換和有監(jiān)督轉(zhuǎn)換。無監(jiān)督轉(zhuǎn)換指只利用特征的統(tǒng)計信息的轉(zhuǎn)換,統(tǒng)計信息包括均值、標(biāo)準(zhǔn)差、邊界等等,比如標(biāo)準(zhǔn)化、PCA法降維等。有監(jiān)督轉(zhuǎn)換指既利用了特征信息又利用了目標(biāo)值信息的轉(zhuǎn)換,比如通過模型選擇特征、LDA法降維等。通過總結(jié)常用的轉(zhuǎn)換類,我們得到下表:
不難看到,只有有信息的轉(zhuǎn)換類的fit方法才實際有用,顯然fit方法的主要工作是獲取特征信息和目標(biāo)值信息,在這點上,fit方法和模型訓(xùn)練時的fit方法就能夠聯(lián)系在一起了:都是通過分析特征和目標(biāo)值,提取有價值的信息,對于轉(zhuǎn)換類來說是某些統(tǒng)計量,對于模型來說可能是特征的權(quán)值系數(shù)等。另外,只有有監(jiān)督的轉(zhuǎn)換類的fit和transform方法才需要特征和目標(biāo)值兩個參數(shù)。fit方法無用不代表其沒實現(xiàn),而是除合法性校驗以外,其并沒有對特征和目標(biāo)值進(jìn)行任何處理,Normalizer的fit方法實現(xiàn)如下:
def fit(self, X, y=None): """Do nothing and return the estimator unchanged This method is just there to implement the usual API and hence work in pipelines. """ X = check_array(X, accept_sparse='csr') return self
基于這些特征處理工作都有共同的方法,那么試想可不可以將他們組合在一起?在本文假設(shè)的場景中,我們可以看到這些工作的組合形式有兩種:流水線式和并行式?;诹魉€組合的工作需要依次進(jìn)行,前一個工作的輸出是后一個工作的輸入;基于并行式的工作可以同時進(jìn)行,其使用同樣的輸入,所有工作完成后將各自的輸出合并之后輸出。sklearn提供了包pipeline來完成流水線式和并行式的工作。
1.2 數(shù)據(jù)初貌
在此,我們?nèi)匀皇褂肐RIS數(shù)據(jù)集來進(jìn)行說明。為了適應(yīng)提出的場景,對原數(shù)據(jù)集需要稍微加工:
from numpy import hstack, vstack, array, median, nan from numpy.random import choice from sklearn.datasets import load_iris #特征矩陣加工 #使用vstack增加一行含缺失值的樣本(nan, nan, nan, nan) #使用hstack增加一列表示花的顏色(0-白、1-黃、2-紅),花的顏色是隨機(jī)的,意味著顏色并不影響花的分類 iris.data = hstack((choice([0, 1, 2], size=iris.data.shape[0]+1).reshape(-1,1), vstack((iris.data, array([nan, nan, nan, nan]).reshape(1,-1))))) #目標(biāo)值向量加工 #增加一個目標(biāo)值,對應(yīng)含缺失值的樣本,值為眾數(shù) iris.target = hstack((iris.target, array([median(iris.target)])))
1.3 關(guān)鍵技術(shù)
并行處理,流水線處理,自動化調(diào)參,持久化是使用sklearn優(yōu)雅地進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘的核心。并行處理和流水線處理將多個特征處理工作,甚至包括模型訓(xùn)練工作組合成一個工作(從代碼的角度來說,即將多個對象組合成了一個對象)。在組合的前提下,自動化調(diào)參技術(shù)幫我們省去了人工調(diào)參的反鎖。訓(xùn)練好的模型是貯存在內(nèi)存中的數(shù)據(jù),持久化能夠?qū)⑦@些數(shù)據(jù)保存在文件系統(tǒng)中,之后使用時無需再進(jìn)行訓(xùn)練,直接從文件系統(tǒng)中加載即可。
2 并行處理
并行處理使得多個特征處理工作能夠并行地進(jìn)行。根據(jù)對特征矩陣的讀取方式不同,可分為整體并行處理和部分并行處理。整體并行處理,即并行處理的每個工作的輸入都是特征矩陣的整體;部分并行處理,即可定義每個工作需要輸入的特征矩陣的列。
2.1 整體并行處理
pipeline包提供了FeatureUnion類來進(jìn)行整體并行處理:
from numpy import log1p from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer from sklearn.preprocessing import Binarizer from sklearn.pipeline import FeatureUnion #新建將整體特征矩陣進(jìn)行對數(shù)函數(shù)轉(zhuǎn)換的對象 step2_1 = ('ToLog', FunctionTransformer(log1p)) #新建將整體特征矩陣進(jìn)行二值化類的對象 step2_2 = ('ToBinary', Binarizer()) #新建整體并行處理對象 #該對象也有fit和transform方法,fit和transform方法均是并行地調(diào)用需要并行處理的對象的fit和transform方法 #參數(shù)transformer_list為需要并行處理的對象列表,該列表為二元組列表,***元為對象的名稱,第二元為對象 step2 = ('FeatureUnion', FeatureUnion(transformer_list=[step2_1, step2_2, step2_3]))
2.2 部分并行處理
整體并行處理有其缺陷,在一些場景下,我們只需要對特征矩陣的某些列進(jìn)行轉(zhuǎn)換,而不是所有列。pipeline并沒有提供相應(yīng)的類(僅OneHotEncoder類實現(xiàn)了該功能),需要我們在FeatureUnion的基礎(chǔ)上進(jìn)行優(yōu)化:
View Code
在本文提出的場景中,我們對特征矩陣的第1列(花的顏色)進(jìn)行定性特征編碼,對第2、3、4列進(jìn)行對數(shù)函數(shù)轉(zhuǎn)換,對第5列進(jìn)行定量特征二值化處理。使用FeatureUnionExt類進(jìn)行部分并行處理的代碼如下:
from numpy import log1p from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer from sklearn.preprocessing import Binarizer #新建將部分特征矩陣進(jìn)行定性特征編碼的對象 step2_1 = ('OneHotEncoder', OneHotEncoder(sparse=False)) #新建將部分特征矩陣進(jìn)行對數(shù)函數(shù)轉(zhuǎn)換的對象 step2_2 = ('ToLog', FunctionTransformer(log1p)) #新建將部分特征矩陣進(jìn)行二值化類的對象 step2_3 = ('ToBinary', Binarizer()) #新建部分并行處理對象 #參數(shù)transformer_list為需要并行處理的對象列表,該列表為二元組列表,***元為對象的名稱,第二元為對象 #參數(shù)idx_list為相應(yīng)的需要讀取的特征矩陣的列 step2 = ('FeatureUnionExt', FeatureUnionExt(transformer_list=[step2_1, step2_2, step2_3], idx_list=[[0], [1, 2, 3], [4]]))
3 流水線處理
pipeline包提供了Pipeline類來進(jìn)行流水線處理。流水線上除***一個工作以外,其他都要執(zhí)行fit_transform方法,且上一個工作輸出作為下一個工作的輸入。***一個工作必須實現(xiàn)fit方法,輸入為上一個工作的輸出;但是不限定一定有transform方法,因為流水線的***一個工作可能是訓(xùn)練!
根據(jù)本文提出的場景,結(jié)合并行處理,構(gòu)建完整的流水線的代碼如下:
from numpy import log1p
from sklearn.preprocessing import Imputer
from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder
from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer
from sklearn.preprocessing import Binarizer
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from sklearn.feature_selection import chi2
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.pipeline import Pipeline
#新建計算缺失值的對象step1 = ('Imputer', Imputer())
#新建將部分特征矩陣進(jìn)行定性特征編碼的對象
step2_1 = ('OneHotEncoder', OneHotEncoder(sparse=False))
#新建將部分特征矩陣進(jìn)行對數(shù)函數(shù)轉(zhuǎn)換的對象
step2_2 = ('ToLog', FunctionTransformer(log1p))
#新建將部分特征矩陣進(jìn)行二值化類的對象
step2_3 = ('ToBinary', Binarizer())
#新建部分并行處理對象,返回值為每個并行工作的輸出的合并
step2 = ('FeatureUnionExt', FeatureUnionExt(transformer_list=[step2_1, step2_2, step2_3], idx_list=[[0], [1, 2, 3], [4]]))
#新建無量綱化對象
step3 = ('MinMaxScaler', MinMaxScaler())
#新建卡方校驗選擇特征的對象
step4 = ('SelectKBest', SelectKBest(chi2, k=3))
#新建PCA降維的對象
step5 = ('PCA', PCA(n_components=2))
#新建邏輯回歸的對象,其為待訓(xùn)練的模型作為流水線的***一步
step6 = ('LogisticRegression', LogisticRegression(penalty='l2'))
#新建流水線處理對象
#參數(shù)steps為需要流水線處理的對象列表,該列表為二元組列表,***元為對象的名稱,第二元為對象
pipeline = Pipeline(steps=[step1, step2, step3, step4, step5, step6])
4 自動化調(diào)參
網(wǎng)格搜索為自動化調(diào)參的常見技術(shù)之一,grid_search包提供了自動化調(diào)參的工具,包括GridSearchCV類。對組合好的對象進(jìn)行訓(xùn)練以及調(diào)參的代碼如下:
from sklearn.grid_search import GridSearchCV
#新建網(wǎng)格搜索對象#***參數(shù)為待訓(xùn)練的模型
#param_grid為待調(diào)參數(shù)組成的網(wǎng)格,字典格式,鍵為參數(shù)名稱(格式“對象名稱__子對象名稱__參數(shù)名稱”),值為可取的參數(shù)值列表
grid_search = GridSearchCV(pipeline, param_grid={'FeatureUnionExt__ToBinary__threshold':[1.0, 2.0, 3.0, 4.0], 'LogisticRegression__C':[0.1, 0.2, 0.4, 0.8]})
#訓(xùn)練以及調(diào)參
grid_search.fit(iris.data, iris.target)
5 持久化
externals.joblib包提供了dump和load方法來持久化和加載內(nèi)存數(shù)據(jù):
#持久化數(shù)據(jù) #***個參數(shù)為內(nèi)存中的對象 #第二個參數(shù)為保存在文件系統(tǒng)中的名稱 #第三個參數(shù)為壓縮級別,0為不壓縮,3為合適的壓縮級別 dump(grid_search, 'grid_search.dmp', compress=3) #從文件系統(tǒng)中加載數(shù)據(jù)到內(nèi)存中 grid_search = load('grid_search.dmp')
6 回顧
注意:組合和持久化都會涉及pickle技術(shù),在sklearn的技術(shù)文檔中有說明,將lambda定義的函數(shù)作為FunctionTransformer的自定義轉(zhuǎn)換函數(shù)將不能pickle化。
“使用Sklearn進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘的步驟”的內(nèi)容就介紹到這里了,感謝大家的閱讀。如果想了解更多行業(yè)相關(guān)的知識可以關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)網(wǎng)站,小編將為大家輸出更多高質(zhì)量的實用文章!
網(wǎng)站名稱:使用Sklearn進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘的步驟
文章來源:http://jinyejixie.com/article38/ipjssp.html
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