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oddratio值在關(guān)聯(lián)分析中的含義是什么

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在GWAS分析中,利用卡方檢驗(yàn),費(fèi)舍爾精確檢等方法,通過判斷p值是否顯著,我們可以分析snp位點(diǎn)與疾病之間是否存在關(guān)聯(lián),然而這得到的僅僅是一個定性的結(jié)論,如果存在關(guān)聯(lián),其關(guān)聯(lián)性究竟有多強(qiáng)呢?

很顯然,我們需要一個量化指標(biāo)來描述關(guān)聯(lián)的強(qiáng)弱程度。類似于相關(guān)性檢驗(yàn),通過p值只能夠說明兩個變量是否相關(guān)。至于其相關(guān)性的大小,是正相關(guān)還是負(fù)相關(guān),還需要結(jié)合相關(guān)系數(shù)來作出判斷。在關(guān)聯(lián)分析中的”相關(guān)系數(shù)”則對應(yīng)兩個常用的統(tǒng)計量, risk ratio和odd ratio。

以探究吸煙和肺癌之間的關(guān)聯(lián)為例,基于的數(shù)據(jù)格式如下


肺癌正常個體
吸煙ab
不吸煙cd

risk ratio, 也叫做relative risk, 簡寫為RR, 通常稱之為相對風(fēng)險度,是暴露組的發(fā)病率與非暴露組的發(fā)病組的比值。對于上述數(shù)據(jù),RR的計算過程如下

吸煙組患肺癌的比例 a / (a + b)

不吸煙組患肺癌的比例 c / (c + d)

RR  = (a / (a + b)) /( c / (c + d))

RR的數(shù)值大小直觀的反映了暴露因素中發(fā)病率的大小,RR>1, 暴露組中發(fā)病率大于非暴露組的發(fā)病率,說明暴露因素和發(fā)病率是正相關(guān)關(guān)系,反之,RR<1, 暴露組中發(fā)病率小于非暴露組的發(fā)病率,說明暴露因素和發(fā)病率是父相關(guān)關(guān)系。如果RR = 1, 兩組發(fā)病率相等,說明暴露因素和發(fā)病率沒有關(guān)聯(lián)。

值得一提的是,在計算過程中使用了抽樣數(shù)據(jù)的頻率來代表發(fā)病的概率,這個只有當(dāng)抽樣數(shù)目非常大才適用, 所以RR值適用于大規(guī)模的隊列樣本。對于常規(guī)的case/control研究,其抽樣的數(shù)目都達(dá)不到這樣的規(guī)模。所以不能直接用上述公式來計算RR,進(jìn)一步提出了odd ratio的概念。

對于罕見疾病,患病的個體數(shù)量遠(yuǎn)小于正常組的數(shù)量,出于這樣的考慮,將上述模型做一個簡化處理,a + b 的值用b里表示,c + d的值有d 來表示,因?yàn)閍遠(yuǎn)小于b, c遠(yuǎn)小于d, 幾乎可以忽略不計,此時上述公式就變成了

(a / b) /  (c / d) = (a d) /( b c)

這個公式計算出的結(jié)果就是odd ratio, 簡稱OR, 也叫做優(yōu)勢比,交叉乘積比等。從上述轉(zhuǎn)換可以看出來,OR其實(shí)是RR的一個估計值,其含義和RR值相同。
通過OR值來定量描述關(guān)聯(lián)性的大小, 使得我們可以直觀比較不同因素和疾病之間關(guān)聯(lián)性的強(qiáng)弱,有助于篩選強(qiáng)關(guān)聯(lián)的因素。

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